然而，在佩服朱翊镠条分缕析说得头头是道的同时，各位大臣也不是没有担心的地方。
“陛下，臣窃以为京察很有必要，但陛下刚登基即位，在这个节骨眼儿上恐怕不是时候啊！”
吏部尚书杨巍率先开口。一来他年纪最大，二来他耿直刚正，当然最重要的是，他身居吏部尚书，如果实行京察就得由他负责。
“杨老为什么说不是时候？”朱翊镠不紧不慢地问。
“臣待罪官场将近四十年了，深知无论新皇登基或是新任首辅上台，要做的第一件事莫不是笼络人心稳定政局。陛下刚登基，大赦天下，君恩浩荡无远弗届，可民有福祉，官亦应该有福祉，所有的官员莫不引领望之侧耳听之，看陛下有何举措，能够让他们从中得到一些好处。倘若等来的是圣意严厉的京察，陛下这么做，臣恐怕陛下会结怨于百官，把官场变成冷冷冰冰荆棘丛生的攻讦之地啊！”
杨巍这番话可谓是肺腑之言，虽然他住了口，可两道吐剑的毫眉还在一耸一耸地显示着内心的激动。
不得不说杨巍真是保养得好，难怪能活到九十多岁呢。（杨巍生于1516年卒于1608年。）一长段话下来，脸不红气不喘，看似精神气儿还旺得很。
朱翊镠听了，心里头有点儿不是滋味，一方面他承认杨巍说的话句句都是忠言，不然也不会第一个站出来明确表示担忧。
但另一方面他也感觉自己这时候提出京察，恐怕以杨巍为代表的某些官员或许并不是真正了解他的动机，以为只是一朝天子一朝臣作用下的结果，目的是为了裁汰万历皇帝重用的官员，就像邱橓等。
朱翊镠沉吟有时，缓缓说道：
“杨老这一席话振聋发聩，朕铭记于心，当深思之。可朕既然已经坐到这个位置上，当以人为本，为务从命，一应国家大政，总以得体为是。天下为公才是朕希望看到的。”
“朕实行严厉的京察，或许会让当官的一家人哭；可倘若纵容官场弊端，到时候就是一路哭一县哭一府哭乃至全国人都哭，哪个更令人痛心？”
“政事顺则民心顺，民心顺则天地之气顺，天地之气顺则阴阳有序。天地人之极，人为主，一国之政顺与不顺，检验民心便可得知，然而欲使民心顺者唯官也，官才是关键。”
“如果百官一个个怙势立威，挟权纵欲，恶人异己，整天无所事事，像今天三份条陈呈送的那样无聊至极，于所言者不言，于所施者不施，其直接后果就是朕的爱民之心得不到贯彻，老百姓的疾苦得不到疏导呼救。”
“这样，将上下阻隔，阴阳不交，人心不畅，倘若出现这种局面，身为一国之主不去大刀阔斧除痈去患，而瞻前顾后畏手畏脚乃至推行妇人之仁，那国家之柄庙堂神器，岂不成了好好先生手中的玩物吗？”
朱翊镠这番话虽然自以为算不上挟雷带火，也只是口由心发娓娓道来，但在座诸位大臣听了，还是让他们无不感到波澜不惊。
杨巍虽然赞赏朱翊镠慨然以天下为己任的襟怀，但对他说的“妇人之仁”观点却颇不以为然。
所以杨巍接着说道：“陛下，臣不是反对京察，一来，京察六年一次考，今年还不到时候；二来，臣只是觉得要温和一些，毕竟陛下才登基即位，不宜大刀阔斧。臣说过，民有福祉，官亦有福祉，陛下为民，也要为官啊，为官谋点利益，怎么能说是妇人之仁呢？”
“朕明白杨老的担忧。”朱翊镠点了点头，见杨巍振振有词，他知道这样理论十天半月也不会有结果。