傅奕乃是唐初学者，唐相州邺人，精于天文历数；唐高祖李渊因其确实有真才实学，拜太史丞，迁太史令。他崇尚儒学和道家学说，傅奕从小博学，聪敏善辩，谈吐流畅。他素不信佛，轻视僧尼，别人崇拜佛像，他却不以为然，认为石象为砖瓦之用，根本不需要参拜。
南北朝以来，佛教盛极一时，寺院遍及各地，僧尼人数与日俱增。傅奕见笃信佛教者甚多，在武德四年六月，他就首次上奏《请废佛法表》，文中记载曰：“窃闻八十老父，击壤而歌；十五少童，鼓腹为乐。耕能让畔，路不拾遗。孝子承家，忠臣满国。庠序成林，墨翟、耿恭之俦，相来羽翊。乃有守道含德，无欲无求。宠辱若惊，职参朝位。”
“定天门之开阖，更新宝位，通万物之逵否，再育黔黎，布李老无为之风，而民自化；执孔子爱敬之礼，而天下孝慈。但闻郊祀上帝，官治民察，未见寺堂铜像，建社宁邦。胡佛邪教，退还天竺；凡是沙门，放归桑梓；令逃课之党，普乐输租；避役之曹，恒忻效力。勿度小秃，长揖国家，自足忠臣，宿卫宗庙。则大唐廓定，作造化之主，百姓无事，为牺皇之民。”
“臣还有益国十一条，还请皇上御览：一是青壮年僧尼不婚不嫁，以致减损户口，且有违天地之化，背阴阳之道，请僧尼六十以下简令作丁，则兵强农劝，有利于国计民生；二是西域诸国兵员虽少，皆得绍其王业，据其土地，自相征伐，屠戮人国，今大唐丁壮僧尼有二十多万，其结胡法，足得人心，应防其不测；三是佛教广致精舍，甲第当衢，虚费金帛，请求诸州县减省寺塔，则民安国治。并且，臣恳请皇上将寺舍分给孤老贫民，无宅义士，规定三万户的州设置一寺，胡僧二人，草堂土塔，以安经像，并销毁铜铁像，不得更铸，以保证泉货不再损毁，益国利人，兴家多福。”
“四是让僧尼衣布省斋，则贫人不饥，蚕无横死者，不让僧尼挥霍浪费；五是断僧尼崌贮则百姓丰满，将士皆富，礼佛不得尊豪，设斋不得富贵；六是帝王不崇信佛教则大治、年长，信佛则虐政、祚短；七是建议将周孔之教封送西域，以抵制佛教思想的流传；八是视佛经为邪说，称其为家鬼，不须广读佛经；九是隐农安近，市廛度中，国富民饶；十是帝王受命皆革前政；十一是直言忠谏，古来出口，祸及其身。”
当初，傅奕首次上书奏请废除佛教，唐高祖李渊根本就没有放在心中，认为是傅奕此人小题大做，佛教根本不足以为惧。但是，傅奕再次上《请除释教疏》，主张禁断佛教。在奏章中，又提出了“生死寿夭，由于自然”的唯物论观点，批判了佛教所宣扬的因果报应说的虚妄。
在教权与皇权的斗争中，傅奕是站在了皇权的一方，进一步陈述了他反佛的思想。傅奕把国家的兴衰治乱统统归之于佛教，显然是有偏向的，因为他只看到了佛教“乱儒教化”的一面，而对封建统治者利用佛教维护其统治则视而不见。
这一次，傅奕提出的观点深深地说中了唐高祖李渊的心思，任何一位君王都不愿意有一家势力凌驾于皇权之上，李渊也是如此。傅奕正是看中了这点，他屡次上疏奏请废除佛教，而且建议唐高祖李渊前往寺庙去实地勘察，就能明白一切。于是，唐高祖李渊当真前往寺庙，只不过是微服私访，看见那些极端的笃信佛教者，就连皇上的命令都不在意，触及了唐高祖李渊的心中的软肋，他担心佛教之人叛离大唐之心，且佛教使臣来往大唐密切，引起了唐高祖李渊的戒备。
恰逢其时，那个时候正是李逍遥率领大军攻打突厥，朝中兵力削弱，一旦佛教徒真的暴动，以京师中的兵力无法与之相抗衡。若非李逍遥率领大军前往突厥，大唐国内兵力虚空，致使唐高祖李渊的警觉，他见识到佛教的影响力后，决定废除佛教，要灭佛。
于是，唐高祖李渊回到皇宫之中就诏令百官议论废除佛教之事，朝臣中信佛者较多，唯有太仆卿张道源支持傅奕的主张，而中书令萧瑀带头发难，攻击傅奕为妄说。萧瑀大声呵斥道：“佛，圣人也。傅大人为此议，非圣人者无法，臣恳请皇上将他严刑查办。”
由于傅奕屡次上疏奏请唐高祖李渊废除佛教，而李渊虽有此心却不能真正的不顾朝中大臣反对。因此，傅奕就直接被唐高祖李渊喊道紫宸殿中，与朝中大臣对峙，将他的观点陈述出来。此时，萧瑀官级别傅奕高许多，而且萧瑀又是跟随李渊起兵的功臣，但是傅奕不畏权势，与萧瑀唇枪舌剑，激烈论争，以一人之力与信佛者展开激烈的争论。
“释迦悯斯涂炭，哀其沈溺，陈经敦劝善以诱贤，制戒律禁恶以惩罪，皆令息妄归真，还源返本；比手中原之地，上古之初，世朴时淳，书契未作，民浇俗伪，典籍方兴。故周公不出于上皇，孔子唯生于下代，制礼作乐，导俗训民，致治兴风，匡时救弊，皆欲令止浇息竞，返素还淳，出于释迦，其揆一也。”
傅奕见萧瑀言辞激烈，他从容不迫地据理反驳道：“礼本事于亲，终于奉上，此则忠孝之理著，臣子之行成。而佛逾城出家，逃背其父，以匹夫而抗天子，以继体而悖所亲。萧瑀非出于空桑，乃遵无父之教。臣闻非孝者无亲，其瑀之谓矣！”
萧瑀被傅奕批驳得哑口无言，想要反驳却又无从下手，只能将双手合十，喃喃地道：“地狱所设，正为是人。”
当时，参加朝会的有太子李建成、秦王李世民等人以及魏徵，太子李建成什么话都没有说，任何意见都没有提出来，不反对也不支持；秦王的态度也是如此，但是张道源却是秦王府的人。因此，张道源的支持使得傅奕成为秦王府的人，与李世民交好，成为秦王府的门人。
秦王李世民之前也不曾将傅奕当成一回事，认为他只不过是文人墨客，根本就不堪重用。但是，经历过朝堂上的激烈争斗，使得李世民对他刮目相看。虽然傅奕太过于极端，反对信佛者，一心想要废除佛教，尊崇道教以及儒学，只不过傅奕敢在唐高祖李渊的面前与朝中权贵据理力争，毫不退缩。
他就知道傅奕定是一位忠君爱国之人，只要傅奕成为秦王府中的人，必定会对秦王李世民尽忠职守，绝对不会叛离。因此，秦王李世民私下里邀请傅奕进王府中一叙，直接了当的表达了自己爱才之心，愿意将他招揽麾下，也是借此告诉于他，只要归附于他的话，傅奕可以继续上疏奏请唐高祖李渊废除佛教，使得傅奕二话不说效忠于李世民。
魏徵等人属于逍遥王府的势力，他们只是站在一边看着，根本就不曾有任何的意见。不过，魏徵也对傅奕不惧权贵的傲骨实在是佩服不已，只不过魏徵知道他已经效忠于秦王，也就不了了之，而且魏徵觉得傅奕所言并非全部没有道理，他也知道佛教徒甚多，一旦真的出现大规模的暴乱，或者被有心人利用的话，后果的确不堪设想，然而李逍遥率领麾下大将全部离开京师，使得魏徵只能作壁上观，不支持也不反对，一切听从唐高祖李渊的意思。